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visualize – realize

arivis Multiple Image Tools GmbH

Lösungen für die wissenschaftliche Bilddatenverarbeitung

arivis bietet Lösungen für den Umgang mit komplexen und prinzipiell unbegrenzt großen Bilddaten.

Das von arivis entwickelte Datenformat sowie die innovativen Softwaresysteme erlauben eine flexible Visualisierung und Analyse dieser Bilddaten. Durch die enge Kopplung mit externen Systemen werden Sie bei der Durchführung Ihrer Experimente optimal unterstützt.
Die arivis Produkte sind modular aufgebaut und flexibel miteinander kombinierbar. Sie erlauben die Aufnahme, Verwaltung, Visualisierung und Auswertung großer, multidimensionaler Bilddaten in wissenschaftlichen und technischen Anwendungen:

• arivis Browser ist ein professionelles Werkzeug zur Datenvisualisierung und -analyse.
  
• arivis WebView unterstützt Sie bei der Visualisierung und Annotation Ihrer multidimensionalen Daten im Internet sowie Intranet.
  
• arivis Viewer ist eine freie Software für die einfache Visualisierung großvolumiger Bilddaten.
  
• arivis ImageCore ist ein Angebot an Software-Entwickler und stellt Kernfunktionen der Software plattformübergreifend für Ihre Projekte bereit.
  
• arivis Platform hilft Ihnen, eine Vielfalt an Daten und Geräten miteinander zu verbinden und unterstützt Sie bei interaktiven Experimenten und Visualisierungen.
  

arivis – das Unternehmen
Die arivis – Multiple Image Tools GmbH ist ein international tätiges deutsches Software-Unternehmen, das 2004 als Spin-off des Fraunhofer-Instituts für Graphische Datenverarbeitung in Rostock gegründet wurde.
In der kurzen Zeit seines Bestehens hat sich das Unternehmen einen Ruf als fairer Anbieter leistungsfähiger Softwarelösungen und als verlässlicher Partner für Projekte und Kooperationen aufgebaut. Davon zeugt die enge Zusammenarbeit mit Partnern von Agilent Technologies bis Carl Zeiss, von der Fraunhofer-Gesellschaft bis zur Max-Planck-Gesellschaft sowie mit Universitäten und Instituten in der gesamten Welt.

arivis Browser

Der arivis Browser ist ein modulares Softwaresystem für die Verwaltung, Visualisierung und Analyse nahezu unbegrenzt großer Bilddaten, das sämtliche Funktionalitäten auch auf normalen PCs anbietet.
Ein wichtiger Einsatzbereich ist die Mikroskopie. Speziell im High Content Screening sowie im Live-Cell-Imaging-Bereich fallen sehr große Bilddaten an, die u. a. als 2D-Bild, als 3D-Bildstapel oder als mehrkanälige Zeitserie von Bildern und Bildstapeln vorliegen können.
Das Datenmanagement des arivis Browser ermöglicht den Umgang mit derart umfangreichen Bilddaten. Das von arivis entwickelte Datenformat kann beliebig viele Kanäle, eine Tiefenachse (z) sowie eine zeitliche Dimension (t) abbilden. Nach einem einfachen Importvorgang stehen Ihnen die Daten für die Visualisierung und Analyse zur Verfügung.

Die wissenschaftliche Analyse mit dem arivis Browser
Ob beim Arbeiten mit Gewebeschnitten oder lebenden Zellen unter dem Mikroskop - die 3D Visualisierung gehört heutzutage zur Routine in der modernen Zell-oder Neurobiologie.

Der arivis Browser unterstützt Ihre Arbeit mit wissenschaftlichen Bilddaten im 2D, 3D und 4D (inkl. Zeitdimension) Bereich. Darunter können folgende Aufgaben fallen:

Aufnahme und Import
Der arivis Browser unterstützt eine Vielzahl von etablierten Datenformaten, die sehr einfach importiert werden können. Profitieren Sie auch von der direkten Kopplung mit bildgebenden Geräten (z. B. Mikroskop, Kamera). Die Größe der entstehenden Bildstapel ist nur durch Ihren Festplattenplatz begrenzt und kann selbst im Terabyte-Bereich liegen.

Visualisierung
Die Bilddaten sind in verschiedenen Ansichten visualisierbar. Neben dem 2D Stack Viewer steht für größere Bildstapel eine Galerie-Ansicht zur Verfügung (Gallery Viewer). Der Split Viewer ermöglicht die gleichzeitige Darstellung verschiedener Ansichtsmodi und Perspektiven.

3D-Visualisierung
Bei einem Bildstapel mit vorhandener Tiefendimension (z) kann der 3D Stack Viewer verwendet werden. Er bietet einen Volumen-Renderer, einen Oberflächen-Renderer (IsoSurface) und einen Orthoslicer zur Visualisierung von Schnitten durch den 3D-Raum. In all diesen 3D-Visualisierungen können Sie interaktiv navigieren.
Ausgewählte Ansichten können ähnlich einer Kamerafahrt zu einem hochwertigen Film zusammengestellt werden.

Farbgebung
Für die Auswertung und Visualisierung Ihrer Bilddaten können Sie die verwendeten Farben sehr flexibel anpassen. Nutzen Sie vordefinierte Farbverläufe, modifizieren Sie die Farben im Kurveneditor oder stellen Sie Standardfarbeigenschaften (z. B. Helligkeit, Kontrast, Alpha) komfortabel ein.

Annotation
Für die Markierung relevanter Bereiche in den Bilddaten stehen verschiedene Annotationswerkzeuge bereit. Neben Linien, Rechtecken oder Ellipsen können Sie auch einfache Punkt- (Marker) oder komplexe Polyline-Annotationen einfügen, die für weiterführende Auswertungen und Visualisierungen zur Verfügung stehen.